한국과 미국 연구진이 새로운 형태의 암진단 알고리즘을 개발했다.
한국연구재단은 3일 건국대학교 김성영 교수 연구팀이 메타 분석 기반 기계학습 알고리즘을 이용해 높은 신뢰도로 암을 구별할 수 있는 인공지능 플랫폼을 개발했다고 밝혔다.
'메타분석'은 의학 분야에서 동일한 주제에 대한 다양한 연구결과를 통합해 결과의 일관성을 평가하고 통계적 정확성을 높이는 기법이다. 김성영 교수 연구팀은 미국 메모리얼 슬로언케터링 암센터 연구진과 함께 이 연구를 진행해 온 것으로 알려졌다.
연구팀은 암조직의 유전자 발현 및 관련 생물경로를 메타분석 기반의 알고리즘을 이용해 통합하고 이를 인공지능을 위한 학습재료로 사용했다. 기계학습 알고리즘을 메타분석과 결합시켜 보다 강건한 모델(MLMA)을 구축했다.
유전체 빅데이터는 보통 '차원의 저주'라 불리는 고차원 문제에 직면하는데 연구팀은 비선형 주성분 분석과 생물경로를 이용한 차원축소 방법이 모델의 일반성과 해석력을 크게 끌어올리는 것을 확인했다.
이렇게 만들어진 알고리즘은 실제 암맹 갑상선암 샘플에 검증한 결과 거의 완벽한 분류 성능을 나타냈다. 갑상선암의 여러 아형을 테스트한 결과 높은 정확도로 이들 아형까지도 구분해냈다. 또, 노화 관련 질환인 점을 고려해 노화인자를 교정한 고위험군에서도 이 모델의 성능을 확인했다.
연구진은 유전체 발현 데이터는 연구자 및 수행기관, 분석플랫폼 별로 예측인자와 모델이 상이해 메타분석 및 생물경로 기반의 알고리즘은 보다 객관적이고 해석력이 뛰어나다고 설명했다.
실제로 연구팀은 다중오믹스 분석으로 갑상선암 관련 생물경로의 조절인자를 찾아내 모델의 해석력을 극대화했다. 개발된 알고리즘은 갑상선암 이외의 다른 암으로도 쉽게 응용될 수 있다.
연구진은 회귀 및 경로 분석 기반의 알고리즘으로 원인분석 및 결과의 일관성을 중시하는 임상에서 선호될 것으로 전망했다.
이번 연구는 과학기술정보통신부와 한국연구재단이 추진하는 기본연구사업 및 바이오·의료기술개발 사업의 지원으로 수행됐다.
한편, 이 연구결과는 수학 및 컴퓨터생물학 분야 국제학술지 '브리핑스 인 바이오인포메틱스(Brief. Bioinform)' 최신호에 실렸다.
<저작권자 ⓒ 한국건강신문, 무단 전재 및 재배포 금지>
- 김상은 기자
[email protected] - 다른기사보기